山东专家团队破解国家重点保护野生植物-玫瑰T2T基因组

原标题： 山东专家团队破解国家重点保护野生植物-玫瑰T2T基因组

近日，闪电新闻记者从山东省自然资源厅获悉，山东省林草种质资源中心专家团队破解国家重点保护野生植物-玫瑰T2T基因组。

据了解，野生玫瑰（Rosa rugosa）是国家重点保护野生植物，隶属于蔷薇科蔷薇属。蔷薇属植物是世界上最受欢迎和栽培最广泛的观赏植物之一。先前发布的玫瑰基因组都有大量未确定或缺失的区域，这阻碍了玫瑰的功能基因组学和遗传改良的研究。近日，山东省林草种质资源中心正高级工程师刘丹课题组破解野生玫瑰首个T2T无间隙参考基因组并揭示调控花色素合成的转录因子。

该研究测序、组装和注释了野生玫瑰的高度连续、完全、端粒到端粒（T2T）参考基因组，鉴定了基因组上的rDNA、端粒及着丝粒序列，为野生玫瑰种质资源的遗传评价和种质创新奠定坚实基础，也为野生玫瑰的遗传学和育种学提供了重要资源。

该研究使用PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C测序数据，对野生玫瑰进行了端粒到端粒（T2T）的从头组装，结果显示玫瑰参考基因组长度为444.55 Mb，含有34,109个蛋白质编码基因。课题组结合多个已发布基因组构建了系统发育树。系统发育树表明，野生玫瑰和月季起源于同一祖先，约550万年前分化为两个物种。基于该T2T基因组，课题组进一步注释了花青素合成通路基因，揭示了潜在调控花青素生物合成的转录因子。

相关论文发表在Horticultural Plant Journal，该期刊位于中国科学院大类学科1区，小类学科园艺1区，农林科学1区，最新影响因子5.7。山东省林草种质资源中心正高级工程师刘丹为该论文的第一作者，高级工程师刘鵾、正高级工程师仝伯强为论文的共同第一作者，解孝满研究员为该文的通讯作者，北京林业大学、南京林业大学、中国科学院、瑞典于默奥大学等单位参与了本研究。该研究获得国家林业和草原局野生植物保护管理、山东省重点研发计划（重大科技创新工程）等项目的资助。

闪电新闻记者 刘少君 报道（刘少君）