南京大学位于南京，中国科技大学位于安徽合肥，从地理位置来看，南京要优于合肥。
但两所高校所属性质不同，南京大学是综合类大学，中国科技大学是理工类大学。两所大学都是985、211大学，国家重点大学。南京大学是教育部直属重点大学，中国科技大学是科学院直属，中央直管副部级建制重点院校。两所高校都有着各自的优势学科，建议根据专业来比较选择。
南京大学设有86个本科专业，有15个学科入选世界一流学科
国家一级重点学科8个，国家二级重点学科13个
国家级特色专业17个。
中国科技大学设有本科专业37个，有11个学科入选世界一流学科
国家一级重点学科8个，国家二级重点学科4个，国家重点培育学科2个
安徽省一级重点学科17个。
在第四轮教育部学科评估中，南京大学的天文学、地质学、图书情报与档案管理进入A等，中国科技大学有七个学科进入A等，分别是:物理学、化学、天文学、地球物理学、科学技术史、核科学与技术、安全科学与工程。
怎么样，实力都相当强大吧？根据自己的分数和专业，合理选择。适合自己的就是最好的。
大家好，我是高校专业那些事
今天我又来讲故事了。。我是某一年考入某985高校。掐指一算已经被离校13年了。
先亮观点:武汉大学综合实力强于中国科学技术大学，但是名气需要进一步增强。首先中科大呢，不用说，大家都知道，是首批985工程大学，c9，211工程大学。
中国科学技术大学综合声誉在国内仅次于清华北大，著名的华东五校之一。和复交浙南同一梯队。
中科大是中科院唯一直属的国家211/985工程全国重点大学。
一个字:牛。
中国科学技术大学牛在哪里?
中国科学技术大学，首先名字牛。中国，科学技术，大学。
主意是科学技术大学，不是科技大学。
你听听这名字，全国最厉害的名字，没有之一，是中国所以科学界大学的老大，技术大学的老大。
现在全国叫科学技术大学的唯一院校
原来的国防科学技术大学，现在已经改名:国防科技大学了。
论校园风景你武大有樱花，我中科大也有额，，
目前中国理工大学，中国工业大学，都没出来吧。
就算有，也没有中国科学技术大学听着霸气。
第二牛，一出生第二年就定位全国重点大学。绝对的含着金钥匙出生，1958年出生，1959年就定位全国重点大学。
成为60全国重点大学。
而民国老重点，老国立大学:武汉大学，浙江大学，南京大学还在重点大学门外面等候呢。
这么快的速度。绝对是空前绝后。
第三牛，首任校长-郭沫若牛。一个文科生，当了科学技术大学的首任校长。
中科院院长。副国级校长。这一点也是吊打清华北大。
第四牛:出国牛中科大以出国为荣，出国比例高居全国第一。
不想当将军的士兵不是好士兵。
不想出国的科大人不是好学生。
不过都是冷门的物理，化学，数学，生物，地质，大气。。。
016 届毕业生出国（境）深造人数为 747 人，占毕业生总数的 14.6%。其中，本科出国（境）553 人，占本科毕业生总人数的31.9%，绝大多数获国外高校全额奖学金资助。根据 2016 U.S. News全球大学排名，毕业生进入全球综合排名前 100 位高校深造的比例为54.9%。本科毕业生进入全球综合排名前 20 和前 100 位高校深造的比例分别为 10.7%和 61.1%。第五牛，就业牛。
第六牛:学科评估牛
然后咱什么再说谁综合实力强?武汉大学实力强。
首先上面的介绍都是牛牛牛，但是实际要看另一套数据集。
终极比较，学科评估，A级学科总数。但是中科大更顶尖。但是综合实力就是武大厉害。我就一句话:上理学，工学选中科大。
上文科，医科上武汉大学。
当然能上中科大，那肯定不上武大
最后，分数，中科大的分数太高。
比武汉大学多了30分，完全不一个档次。最后建议:中科大好好发展一下工科。文科不好就业，理科也不好就业，。期待你的关注点赞，这是我这篇回答最大的期待
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